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肠出血性大肠杆菌的电子显微镜照片
中国深圳华大基因研究院和德国汉堡-埃彭多夫大学医学院2日宣布，由中德科学家联合进行基因研究结果显示，导致近期德国肠道病感染疫情的是由一种新的兼具侵袭、产毒、肠出血等特征的大肠杆菌。
深圳华大基因研究院发表的新闻公报说，在一项由该研究院、德国汉堡-埃彭多夫大学医学院、中国疾病预防与控制中心和军事医学科学院微生物流行病研究所联合进行的研究中，研究人员利用第三代测序仪“Ion Torrent”对在德国流行的病菌进行了全基因组测序，并通过对序列的分析发现该菌株属于血清型O104大肠杆菌。但是，O104型大肠杆菌以前未见引起人类大规模感染的报道。研究人员通过进一步比对分析发现该菌株与2002年从中非艾滋病患者腹泻标本中分离的肠聚集性大肠杆菌55989菌株的同源性超过93%。对基因序列的分析结果显示，导致德国疫情的菌株通过基因水平转移获得了肠出血性大肠杆菌的毒力基因和毒力相关质粒，这可能与该菌株强毒性和重症感染有关。
研究还发现，该菌株携带氨基糖甙类、大环内酯类、磺胺类等抗生素的耐药基因，导致抗生素治疗无效。
中国科学家还将进一步分析这些毒力相关基因的完整性和表达情况以及耐药和毒力基因水平转移机制，并在更多德国流行菌株中进行验证。
汉堡-埃彭多夫大学医学院细菌专家罗德2日说，这项德中联合研究在德国流行的致病菌中发现了两种完全不同的细菌的部分基因。这一新组合有利于病菌在肠细胞上附着，从而使其能在肠道内宿居更长时间，造成更大的破坏。此外，这种病菌还对抗生素具有很强的抗药性。罗德称这种新型病菌“是常见的肠出血性大肠杆菌的一个非常远的远亲”。
据中国深圳华大基因研究院介绍，德国大肠杆菌疫情发生后，该研究院立即与德方研究机构建立联系开展合作，并成立专门研究小组对该细菌进行测序和生物信息学分析。在获得病菌样本后3天的时间内，华大基因就完成了对这种新型大肠杆菌的基因组测序。
在过去3周多时间内，肠出血性大肠杆菌疫情已在德国造成约2000例确诊或疑似病例，至少18人死亡。
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