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华中农大完成我国首个果树基因组序列图谱

发布时间:2012年03月22日 15:46 | 进入复兴论坛 | 来源:新华网 | 手机看视频


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  华中农业大学21日对外公布了甜橙全基因组序列图谱。华中农大的园艺学、基因组学、生物信息学科研人员,经过一年多的努力,破解了甜橙基因“密码”,完成了甜橙基因组拼接与注释,获得了较高质量的甜橙基因组。这是中国自主完成的第一个果树作物基因组序列图谱,也是世界上目前最为完整的甜橙全基因组序列图谱。

  课题牵头人、中国工程院院士、国家柑橘产业体系首席科学家、华中农业大学教授邓秀新说:“这标志着我国在生物技术和功能基因组合上搭建起一个很好的科研平台,也对促进柑橘的品种改良,全面提升产业竞争力具有重要意义。”

  甜橙是世界第一大柑橘类型,产量占全世界柑橘产量的60%。我国是世界上重要的柑橘原生中心,2010年中国总产量2645万吨,是世界柑橘第一生产大国。

  华中农业大学博士徐强介绍说,甜橙具有多胚、雄或/和雌不育、遗传背景高度杂合等特点,阻碍了遗传学及育种的发展。完整的基因组信息,作为一个遗传框架,将为柑橘遗传与育种改良提供科学的依据。

  华中农业大学此次甜橙基因组测序采用全基因组鸟枪法(WGS)策略,进行双末端测序,得到数据总量约为200G,拼接后的序列覆盖87%的柑橘基因组,获得注释的基因近3万个。

  邓秀新说,甜橙基因组序列图谱的完成,如同打开了甜橙生命活动的“黑匣子”,破解了甜橙基因“密码”,得到了基因组合的排列顺序和相关特征。对于今后研究中,有意识地锁定甜橙成熟期、色泽、含糖量、产量、抗病性等农艺性状提供了良好的基础,有利于培养出更好、更健康的品种来。

  此次甜橙全基因组序列图谱使中国在柑橘基因的基础研究上与国际接轨。“这为中国将来的生物技术发展提供更多的可能,也有利于打破国外对中国的一些技术封锁。”邓秀新说。21日,甜橙基因组网站(http:// citrus.hzau.edu.cn)已经上网,面向国内的专家学者,为学术研究提供免费数据分析。

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